پیش‌بینی هفت فاکتور رونویسی کاندید در لوسمی لنفوبلاستیک حاد سلول‌های B با استفاده از روش‌های سیستم بیولوژی

زمینه و هدف: بیماری لوسمی لنفوبلاستیک حاد B (BALL)، با آسیب به DNA خود باعث ایجاد سلول‌هایی با قابلیت رشد غیرقابل کنترل می‌شود. هدف از این مطالعه یافتن روش‌های نوین مناسب تشخیصی و درمانی با استفاده از بیان افتراقی ژن‌ها و آنالیزهای پروتئینی در روش‌های مختلف سیستم بیولوژی بود. روش بررسی: کتابخانه میکرواری GSE20011 توسط دیتابیس GEO استخراج و با نرم‌افزار GEO2R آنالیز شد. در این مطالعه دو گروه کنترل (دچار سرطان لنفوم هوچکین خوش‌خیم) و تیمار (مبتلا به لوسمی لنفوبلاستیک حاد سلول‌های B) با هم مقایسه شدند. در سرطان BALL، ۳۳۸ ژن، افزایش بیان و ۲۵۲ ژن، کاهش بیان داشتند که بررسی‌های پروتئین کینازی و فاکتورهای رونویسی، عملکرد ژن‌ها، واکنش‌های مابین پروتئینی و درنهایت، رسم شبکه پروتئینی ژن‌های افتراقی به ترتیب به‌وسیله پایگاه‌های داده‌ای KEA، ChEA، DAVID، Gene2Network و yEd انجام و رسم گردید. یافته‌ها: در این مطالعه برای اولین‌بار، هفت فاکتور رونویسی CUX1, LMO2, POU3F2, TET1, SPI1, LYL1, ELF1  برای BALL به‌عنوان کاندید تشخیص و درمان گزارش شدند. همچنین اهمیت نقش غشا در سلول‌های BALL با عملکرد 97 ژن افزایش بیان‌یافته از کل 338 ژن در غشاهای سلولی، اهمیت بالای حفظ غشا را نشان داد و 97 ژن در عملکرد مقاومت سلولی برای سلول‌های BALL شناسایی ‌شدند که می‌تواند تفسیرکننده مقاومت بالای سلولی‌های BALL به روش‌های درمانی از نگاه مولکولی فرض گردد. نتیجه‌گیری: نتایج این مطالعه، می‌تواند به فهم بهتر مکانیسم مقاومت سلولی BALL در برابر درمان، ارائه هفت پروتئین کاندید تشخیص و احتمالاً درمان کمک کند.